misinterpretという単語は、「誤って解釈する」という意味で、特に何かを間違った意味で捉えたり理解したりすることを指します。例えば、「I misinterpreted her smile as a sign of agreement.(私は彼女の笑顔を同意のサインだと誤解しました)」というように使います。
confuseという単語は、「混同する」という意味で、複数のものを間違えて同じものだと思ってしまうことを表します。例えば、「Please don't confuse me with your complicated explanations.(あなたの複雑な説明で私を混乱させないでください)」という形で用いられます。